MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 2691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011988	GCG	2	6	1002514	1002519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_011988	TC	3	6	1003647	1003652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2003	NC_011988	GCG	2	6	1003655	1003660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_011988	GC	3	6	1003678	1003683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2005	NC_011988	AACCG	2	10	1003785	1003794	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2006	NC_011988	GCA	2	6	1004638	1004643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_011988	A	7	7	1004671	1004677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_011988	AT	3	6	1004814	1004819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_011988	GAT	2	6	1004872	1004877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_011988	GGCAA	2	10	1004891	1004900	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2011	NC_011988	GAT	2	6	1004947	1004952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_011988	CAA	2	6	1005073	1005078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_011988	AGC	2	6	1005126	1005131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_011988	ATTC	2	8	1005135	1005142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2015	NC_011988	TAT	2	6	1005243	1005248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_011988	TTGT	2	8	1005250	1005257	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_011988	A	6	6	1005273	1005278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_011988	TGC	2	6	1005292	1005297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_011988	CATAT	2	10	1005319	1005328	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2021	NC_011988	A	7	7	1005372	1005378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_011988	AC	3	6	1005574	1005579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2023	NC_011988	TGT	2	6	1005637	1005642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2063	NC_011988	T	6	6	1031928	1031933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2132	NC_011988	TGA	2	6	1046337	1046342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2136	NC_011988	CCA	2	6	1046698	1046703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2259	NC_011988	A	6	6	1071648	1071653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2392	NC_011988	GAC	2	6	1154097	1154102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2393	NC_011988	TGA	2	6	1154114	1154119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2394	NC_011988	GAT	2	6	1154124	1154129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2395	NC_011988	ATA	2	6	1154238	1154243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2396	NC_011988	CAA	2	6	1156933	1156938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2397	NC_011988	TCT	2	6	1156949	1156954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2398	NC_011988	A	6	6	1157005	1157010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2399	NC_011988	ACCG	2	8	1157090	1157097	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2400	NC_011988	GA	3	6	1158154	1158159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2401	NC_011988	AGTC	2	8	1158166	1158173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2402	NC_011988	GAAG	2	8	1158190	1158197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2403	NC_011988	GT	3	6	1158261	1158266	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2404	NC_011988	C	6	6	1160648	1160653	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2405	NC_011988	GCTAT	2	10	1160670	1160679	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2406	NC_011988	TTA	2	6	1160790	1160795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2407	NC_011988	GCGT	2	8	1161418	1161425	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2408	NC_011988	TGG	2	6	1161901	1161906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2409	NC_011988	GC	3	6	1161926	1161931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2410	NC_011988	TCG	2	6	1162016	1162021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2412	NC_011988	CTA	2	6	1162056	1162061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2413	NC_011988	ATC	2	6	1162073	1162078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2414	NC_011988	TCTTT	2	10	1162135	1162144	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2415	NC_011988	AT	3	6	1162182	1162187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2416	NC_011988	ATC	2	6	1162242	1162247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2417	NC_011988	GGC	2	6	1162281	1162286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2418	NC_011988	CAGT	2	8	1162303	1162310	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2419	NC_011988	GC	3	6	1162567	1162572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2420	NC_011988	TGT	2	6	1166576	1166581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2424	NC_011988	ATCA	2	8	1166675	1166682	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2425	NC_011988	CGGA	2	8	1166686	1166693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2426	NC_011988	CCG	2	6	1166710	1166715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2427	NC_011988	TGT	2	6	1167516	1167521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2428	NC_011988	CAGA	2	8	1167598	1167605	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2429	NC_011988	ACCGT	2	10	1167691	1167700	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2430	NC_011988	A	7	7	1167732	1167738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2431	NC_011988	TGGGT	2	10	1167782	1167791	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
2432	NC_011988	CT	3	6	1169171	1169176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2433	NC_011988	TCA	2	6	1169234	1169239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2434	NC_011988	CAG	2	6	1169277	1169282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2437	NC_011988	CCTTG	2	10	1169404	1169413	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2438	NC_011988	AGT	2	6	1169422	1169427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2450	NC_011988	TCTCT	2	10	1169905	1169914	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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2452	NC_011988	CGC	2	6	1169979	1169984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2454	NC_011988	TTTG	2	8	1170076	1170083	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2462	NC_011988	CTTC	2	8	1174031	1174038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2463	NC_011988	TCT	2	6	1174132	1174137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2481	NC_011988	ATA	2	6	1177342	1177347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2482	NC_011988	GTT	2	6	1177436	1177441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2490	NC_011988	GCAAAG	2	12	1178928	1178939	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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2493	NC_011988	GCG	2	6	1180622	1180627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2495	NC_011988	GCATT	2	10	1180708	1180717	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2496	NC_011988	CGG	2	6	1180820	1180825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2497	NC_011988	TGA	2	6	1180874	1180879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2498	NC_011988	GGC	2	6	1180925	1180930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2500	NC_011988	AGA	2	6	1180943	1180948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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